파티마 왕조는 자신들이 무함마드의 딸 파티마와 알리의 후손이라고 주장한 이스마일파(시아파의 한 갈래) 지도자들이 909년 지금의 튀니지에서 세웠다. 이들은 바그다드의 아바스 칼리파를 인정하지 않고 스스로 칼리파라 칭했다.
969년 파티마 군대는 이집트를 정복하고 옛 도시 푸스타트 옆에 새 수도 카이로(알카히라, ‘승리자’)를 세웠다. 970~972년에 지어진 알아즈하르 모스크는 곧 학문을 가르치는 곳이 되었고, 지금은 수니파 이슬람의 대표적인 교육 기관이다.
파티마 왕조는 지중해와 홍해, 인도양을 잇는 무역으로 번영했고, 한때 시리아와 메카·메디나까지 영향력을 미쳤다. 그러나 11세기 이후 내분과 셀주크·십자군의 압박으로 약해졌고, 1171년 살라흐 앗딘(살라딘)이 마지막 칼리파의 죽음과 함께 왕조를 끝냈다.